Bioquimica

Bioquimica

(Parte 1 de 8)

BIOQUÍMICA QBQ220N Biologia Noturno

Professores

Alexander Henning Ulrich Hugo Aguirre Armelin

APRESENTAÇÃO5
INTRODUÇÃO E NORMAS GERAIS5
NORMAS E RECOMEDAÇÕES NO LABORATÓRIO6
GUIA PARA RELATÓRIO DE LABORATÓRIO6
AVALIAÇÃO7
BIBLIOGRAFIA RECOMENDADA7
CALENDÁRIO DE MÓDULOS E ATIVIDADES 20068
MÓDULO 1: REAÇÃO ÁCIDO-BASE, PH E SISTEMA TAMPÃO10
Grupos de discussâo 11
MÓDULO 2: AMINOÁCIDOS12
Grupo de discussão 212
MÓDULO 3: ESTRUTURA PRIMÁRIA DE PROTEÍNAS15
Grupo de discussão 316
MÓDULO 4: ESTRUTURA SECUNDÁRIA E TERCIÁRIA DE PROTEÍNAS17
Grupo de discussão 420
MÓDULO 5: CINÉTICA E TERMODINÂMICA21
Grupo de discussão 525
MÓDULO 6: CINÉTICA ENZIMÁTICA26
Grupo de discussão 630
MÓDULO 7: MECANISMOS DE CATÁLISE ENZIMÁTICA32
Grupo de discussão 734
MÓDULO 8: AÇÚCARES: ESTRUTURA E FUNÇÃO35
MÓDULO 9: GLICÓLISE40
Grupo de discussão 943
MÓDULO 10: CICLO DE KREBS4
Grupo de discussão 1045
MÓDULO 1: CADEIA RESPIRATÓRIA E FOSFORILAÇÃO OXIDATIVA46
Grupo de discussão 148
MÓDULO 12: GLICONEOGÊNESE49
Grupo de discussão 1250
MÓDULO 13. ÁCIDOS GRAXOS: ESTRUTURA, FUNÇÃO E METABOLISMO51
Grupo de discussão 1354
MÓDULO 14: LÍPIDES, MEMBRANA & TRANSPORTE5
Grupo de discussão 1458
MÓDULO 15: CICLO DAS PENTOSES60
Grupo de discussão 1561
MÓDULO 16 E 17 – FOTOSSÍNTESE62
Grupo de discussão 1663
Grupo de discussão 1764
MÓDULO 18: METABOLISMO DO GLICOGÊNIO65
Grupo de discussão 1867
MÓDULO 19: CONTROLE HORMONAL DO METABOLISMO67
Grupo de discussão 1971
MÓDULO 20: METABOLISMO DE AMINOÁCIDOS72
Grupo de discussão 2073
MÓDULO 21: CICLO DO NITROGÊNIO73
Grupo de discussão 2174
MICROPIPETADORES76

3 LABORATÓRIO 1: FOTOMETRIA E ESPECTROFOTÔMETRO .....................................................78

IFUNDAMENTOS .................................................................................................................... 78
I. OBJETIVOS80
I. PROCEDIMENTO EXPERIMENTAL80
IV. RELATÓRIO DE LABORATÓRIO 182
LABORATÓRIO 2: TITULAÇÃO E CROMATOGRAFIA DE AMINOÁCIDOS84
IFUNDAMENTOS .................................................................................................................... 84
I. OBJETIVOS87
I. PROCEDIMENTO EXPERIMENTAL87
IV. RELATÓRIO DE LABORATÓRIO 289
LABORATÓRIO 3: CINÉTICA ENZIMÁTICA90
IFUNDAMENTOS .................................................................................................................... 90
I. OBJETIVOS93
I. PROCEDIMENTO EXPERIMENTAL93
IV. RELATÓRIO DE LABORATÓRIO 396
LABORATÓRIO 4: PURIFICAÇÃO DE PROTEÍNAS (SDS-PAGE E PONTO ISOELÉTRICO)97
IFUNDAMENTOS .................................................................................................................... 97
I. OBJETIVOS9
I. PROCEDIMENTO EXPERIMENTAL9
IV. RELATÓRIO DE LABORATÓRIO 4101
VAPÊNDICE...........................................................................................................................104
LABORATÓRIO 5: REAÇÃO DE TRANSAMINAÇÃO107
IFUNDAMENTOS .................................................................................................................. 107
I. OBJETIVOS109
I. PROCEDIMENTO EXPERIMENTAL109

4 IV. RELATÓRIO DE LABORATÓRIO 5 ....................................................................................110

Prof. Dr. Alexander Henning UlrichBloco 8 Sup., Sala 858

Prof. Dr. Hugo Aguirre Armelin (coordenador) Bloco 9 Inf., Sala 924

Doutorando Cleber Augusto TrujilloBloco 8 Sup., Sala 858
Doutoranda Katia Neves GomesBloco 8 Sup., Sala 858

A disciplina de Bioquímica (QBQ220-noturno) compreende o programa de módulos mostrado no calendário das páginas 8 e 9. Cada módulo focaliza um tópico a ser desenvolvido em um dia de aula, envolvendo 3 atividades: a) Aula expositiva pelo professor; b) Grupos de discussão centrados em questões objetivas; c) Fechamento do tema pelo professor que analisará as questões discutidas em grupo.

Além destes módulos, desenvolvidos em sala de aula, haverá também um conjunto de módulos de laboratório, consistindo em 5 aulas práticas concentradas no último mês de curso. Os grupos de discussão serão formados por 6 alunos, organizados no primeiro dia de aula permanecendo fixos por todo o curso. Para as aulas de laboratório cada grupo será dividido em 2: A e B. Cada módulo de laboratório consistirá em 3 atividades: a) Execução da aula prática no laboratório; b) Trabalho em sala de aula; c) Relatório que será realizado em sala de aula.

No primeiro dia de cada modulo de laboratório, o conjunto de subgrupos A trabalhará no laboratório, enquanto os subgrupos B estarão na sala de aula. No período seguinte inverte-se: subgrupos B no laboratório e subgrupos A na sala de aula. Finalmente, no último período, os subgrupos se reúnem na sala de aula para discutir, conciliar resultado e fazer um relatório de grupo, que deve ser entregue no mesmo dia.

Em cada módulo de laboratório, os subgrupos da turma A trabalharão no laboratório enquanto os subgrupos da turma B estarão na sala de aula para discutir e conciliar os resultados obtidos na aula prática e para fazer um relatório de grupo, que deverá ser entregue no mesmo dia. No período seguinte, inverte-se: os subgrupos da turma B no laboratório e subgrupos da turma A na sala de aula. Seguir rigorosamente as seguintes instruções:

- Leia com detalhe o procedimento experimental (protocolo) e preste atenção às instruções fornecidas antes de iniciar a experiência.

- Procure utilizar reagentes, vidraria e equipamentos disponíveis com cuidado, para evitar desperdício e quebra.

- Mantenha sua área de trabalho organizada. Ao terminar a experiência passe água na vidraria utilizada e a coloque no local indicado.

- Em caso de dúvida ou acidente, peça auxílio aos monitores ou aos professores.

- Uso do avental nas aulas práticas é obrigatório!

OBJETIVOS: Colocar o(s) objetivo(s) da aula prática de forma clara e concisa. INTRODUÇÃO: Deve conter os fundamentos bioquímicos da metodologia empregada (aspectos teóricos da aula prática encontrados na literatura).

MATERIAIS E MÉTODOS: Descrever os procedimentos executados em laboratório incluindo todos os reagentes, materiais e equipamentos utilizados.

RESULTADOS E DISCUSSÃO: Colocar todos os dados obtidos (utilizar tabelas, caso julgue necessário). Os gráficos serão aceitos em papel milimetrado ou no Excel. Comentar os resultados comparando turma A e B, discutir possíveis diferenças obtidas comparando com dados da literatura.

CONCLUSÃO: Comentar quais as conclusões da aula prática. Ser claro e objetivo nas conclusões.

Esclarecer se os objetivos propostos foram atingidos ou não. BIBLIOGRAFIA: Colocar todos os livros e artigos consultados.

NÃO ULTRAPASSAR 5 PÁGINAS DE RELATÓRIO!

A avaliação de desempenho será composta dos seguintes itens: a) Provas em grupo (PG1 a PG6), que consistirão num trabalho em grupo para resolução de questões objetivas por um período de 4 h; b) Relatórios de laboratório (R1 a R5); c) Provas escritas individuais (P1, P2 e P3). A última prova escrita da matéria será sobre os temas abordados em laboratório.

O cálculo da media final será feito através da seguinte formula:

Haverá uma única prova substitutiva para substituir uma das provas individuais de avaliação. Reposições de PG ou relatório de laboratório estão vetados. A presença em todas as atividades é obrigatória. Uma lista de presença será passada em todas as aula. Alunos que alcançarem a média final ≥ 5,0 e mostrarem freqüência ≥ 70% estarão aprovados. Aqueles cuja média for no mínimo igual a 3,0 e apresentarem freqüência ≥ 70% poderão fazer a prova de recuperação.

BIBLIOGRAFIA RECOMENDADA A bibliografia recomendada envolve 2 livros textos em português:

TORRES, B. B. & MARZZOCCO, A. Bioquímica Básica. VOET, D. ; VOET, J. & PRATT, C. W. Fundamentos de Bioquímica.

Contudo, outros excelentes textos de Bioquímica, em geral em inglês, poderão ser usados com igual proveito:

VOET, D. & VOET, J. Biochemistry. STRYER, L.; BERG, J. M. AND TYMOCZKO, J. L. Biochemistry. LEHNINGER, A. L. Principles of Biochemistry.

CALENDÁRIO DE MÓDULOS E ATIVIDADES 2006

JULHO 31 1 ÁGUA; REAÇÃO ÁCIDO-BASE, pH E SISTEMA TAMPÃO. AGOSTO 3 2 AMINOÁCIDOS: Estrutura, Propriedades Químicas. 4 3 PROTEÍNAS: Estrutura Primária. 7 - PROTEÍNAS: Estrutura 3D e Conformação. 10 4 PG-1. 1 5 INTRODUÇÃO À CINÉTICA E TERMODINÂMICA QUÍMICA. 14 6 CINÉTICA ENZIMÁTICA. 17 7 MECANISMOS DE CATÁLISE ENZIMÁTICA. 18 - PG-2. 21 - AVALIAÇÃO 1. 24 8 AÇUCARES ESTRUTURA E FUNÇÃO. 25 9 GLICÓLISE. 28 10 ACETIL-CoA E CICLO DE KREBS 31 1 CADEIA RESPIRATÓRIA E FOSFORILAÇÃO OXIDATIVA SETEMBRO 1 12 GLICONEOGÊNESE 4-8 - SEMANA DA PÁTRIA. 1 - .PG-3. 14 - AVALIAÇÃO 2 15 13 ÁCIDOS GRAXOS:ESTRUTURA, FUNÇÕES E METABOLISMO. 18 14 LIPÍDEOS, MEMBRANA E TRANSPORTE. 21 - PG-4. 2 15 CICLO DAS PENTOSES. 25-29 - SEMANA TEMÁTICA DA BIOLOGIA. OUTUBRO 2 16 FOTOSSÍNTESE 1. 5 17 FOTOSSÍNTESE 2. 6 - PG-5 9 18 METABOLISMO DO GLICOGÊNIO. 12 - FERIADO 13 - RECESSO 16 19 CONTROLE HORMONAL DO METABOLISMO.

19 20 METABOLISMO DE AMINOÁCIDOS. 20 21 CICLO DO NITROGÊNIO. 23 - PG-6. 26 - AVALIAÇÃO 3.

L1-A MÉTODOS COLORIMÉTRICOS E ESPECTRO DE ABSORÇÃO. LABORATÓRIO* 27

L1-B MÉTODOS COLORIMÉTRICOS E ESPECTRO DE ABSORÇÃO. 30

R1-A RELATÓRIO.

NOVEMBRO 2 FERIADO 3 .RECESSO

L2-A TITULAÇÃO E SEPARAÇÃO DE AMINOÁCIDOS. 6

R1-B RELATÓRIO

L2-B TITULAÇÃO E SEPARAÇÃO DE AMINOÁCIDOS 9

R2-A RELATÓRIO.

L3-A CINÉTICA ENZIMÁTICA, INVERTASE. 10

R2-B RELATÓRIO.

L3-B CINÉTICA ENZIMÁTICA, INVERTASE. 13

R3-A RELATÓRIO.

L4-A FRACIONAMENTO DE PROTEÍNAS. 16

R3-B RELATÓRIO.

L4-B FRACIONAMENTO DE PROTEÍNAS. 17

R4-A RELATÓRIO.

L5-A MECANISMOS DE CATÁLISE, TRANSAMINASES. 20

R4-B RELATÓRIO.

L5-B MECANISMOS DE CATÁLISE, TRANSAMINASES. 23

(Parte 1 de 8)

Comentários