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Assunto: Metabolismo do RNA
Prof: José Hélio Costa
Transmissão da informação genética
ee" 00". Te
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*
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' DNA
Single-stranded DNA LN AN AN ANA
t
" o” o “a
Reverse transcription's, AAA! Transcription
“ecancer RNA 1 and replication
ane?
Protein
TRANSCRIÇÃO - RNA polimerase (adiciona ribonucleotídeos trifosfato: ATP; GTP; UTP; CTP) - Direção de síntese 5’ para 3’ - Sem atividade 3’ para 5’ - Não requer primer inicial e envolve apenas curtos segmentos de DNA. Apenas 1 fita do DNA é usada como molde; - Sintese de RNAs: mRNA; rRNAs; tRNAs e snRNAs - Em plantas ocorre no núcleo, mitocôndrias e plastídeos Núclear Organelar plastídio/mitocôndria É um peptídeo simples codificado pelo núcleo. Foram identificadas nos plastídeos, mas acredita-se que ambas as enzimas podem estar presentes na mitocôndria As subunidades são codificadas pelo DNA plastídeo enquanto a subunidade (sigma) é codificada pelo núcleo. RNA Pol. I – rRNAs (25S, 17S e 5,8S) RNA Pol. II – mRNA, U1, U2, U4, U5 RNA Pol. III – (Classe I) rRNA 5S RNA Pol. III – (Classe II) tRNAs RNA Pol. III – (Classe III) U3; U6 e outros snRNAs TRANSCRIÇÃO: As RNA polimerases TRANSCRIÇÃO Reconhecimento de promotores por RNA polimerases Eucariótico (genes nucleares) procariótico (genes organelares) Alongamento
Negative
Positive
supercoils
Direction of transcription
(b)
(5) CGCTATAGCGTTT(3) | DNA nontemplate (coding) strand
(3) GCGATATCGCAAA(5) | DNA template strand
DA transcripts
—+— —> > e mm — > >
DNA
3.6 x 10! bp
Características e Funções dos RNAs rRNAs (25S; 23S; 17S e 16S) tRNAs e outros RNAs menores (4S) mRNA? 1 a 2% do RNA total Abundância: S = Svedberg, As moléculas de RNAs são comumente designadas de acordo com o coeficiente de sedimentação medido em unidades de Svedberg Características e Funções dos RNAs: rRNAs Tipos: Citoplasmáticos: 25S; 17S, 5S e 5,8S Plastídicos: 23S; 16S e 4,5S Mitocondriais: 23S; 16S e 5S - Constituição das subunidades ribossômicas Ribossomos 70S (procarióticos) - Subunidade 50S (rRNA 23S e rRNA 5S) - Subunidade 30S (rRNA 16S) Ribossomos 80S (eucarióticos) - Subunidade 60S (rRNA 25S; rRNA 5,8S e rRNA 5S ) - Subunidade 40S (rRNA 17S) Características e Funções dos RNAs: rRNAs - RNAs ribossomais podem formar complexas estruturas secundárias Isso ocorre através de pareamento entre sequências complementares em diferentes segmentos da fita simples do RNA. Junto com proteínas vão formas as subunidades ribossômicas (responsáveis pela passagem da mensagem genética de um mRNA para dar uma proteína Características e Funções dos RNAs: mRNAs - mRNAs: Carregam a informação genética contida no DNA referente a um produto protéico. Tamanho variado; Mais sensíveis a degradação do que os tRNAs e rRNAs; 1 a 2% do RNA total; Não formam tantas estruturas secundárias Não são visualizados em Gel de agarose corado com brometo de etídio Tipos: Citoplasmáticos: extensivamente modificados após transcrição Organelares: Características e Funções dos RNAs: mRNAs Na mitocôndria é um grupo trifosfato “Loop” com função regulatória e estabilizante CAP e Cauda poliA (20 a 250 resíduos) -Papel na iniciação da tradução - proteção contra degradação 5’ e 3’ UTRs podem formar estruturas secundárias e interagir com proteínas regulando o transporte, a tradução e a estabilidade do mRNA. E os introns q ainda podem ter!!!! Características e Funções dos RNAs: pequenos RNAs Tipo Nomes Localização Função snRNAs: U1, U2, U4 a U9, U11, U12 Núcleo Processamento de pré-mRNA U7 Núcleo - processamento de pré-mRNA de histonas - adição de poli A snoRNAs U3, U8, U13 a U40 Nucléolo Processamento de pré-rRNA outros RNase P Núcleo, plastídeo e mitocôndria Processamento de pré-tRNA Modificações pós-transcripcionais do mRNA
CAPEAMENTO DA
EXTREMIDADE 5º
guanine-7-methyltransferase
(b)
5
* End of RNA
with triphosphate group
vBa
PppNp
phosphohydrolase
ppNp
guanylyltransferase
GpppNp
Mm adoMet
Ns adoHey
m'GpppNp
2'-O-methyltransferase
adoMet
Ns adoHey
m'GpppmNp
5' End of RNA with cap
Modificações pós-transcripcionais do mRNA
- POLIADENILAÇÃO
DA EXTREMIDADE 3º
RNA polymerase
Template DNA ;
5
Cap RNA
(a)
Enzyme
complex
5 3"
(b) endonuclease bri
5' Essa 0 H(3')
ATP
(ce) polyadenylate PP;
polymerase
5 aa AA MCA) —OH(3')
INTRONS: Encontrados nos RNAs codificados pelos 3 genomas de plantas (AJ Group T
5
5
, Exon 1
Exon 1
o
, Exon 1
é
Exon 2
INTRONS: mecanismos de splicing,
mitocôndria e plastídeos
Exon 2
y
Guanosine cofactor
attacks 5 splice site
Exon 2
y
Cleavage of 3º splice site
Ligation of exons
3+ 560 13
(B) Group II
Exon | Exon 2
E O
Adenosine in intron
attacks 5" splice site
Exon Exon 2
E E y
Cleavage of 3º splice site
Ligation of exons
Exonl Exonê
E o
Grupo I
Intron
the phosphate at
C The 3º OH of guanosine
acts as a nucleophile,
attacking
the 5º splice site.
5 mm US OH x
The 3º OH of'the 5'exon.
becomes the nucleophile,
completing the reaction.
Up 3º
Grupo II
Intron
Primary |
transeript
» ”
The 2º0H af a specific adenosine
in the intron acts as a nucleophile,
attacking the 5º splice site to form
a lariat structure,
Intermediate
5 > v-om
The &º OH of the 5º exon acts
as a nueleophile, completing
the renction.
Spliced RNA
5 gar OUS)
RNAs precursores são extensivamente processados para produzir moléculas de RNAs funcionais Pré-rRNA nuclear